ওয়াটসঅ্যাপের গোপনীয়তা নিয়ে কম সমালোচনা হচ্ছে না। অধিগ্রহণ করার পর থেকেই ইন্সট্যান্ট মেসেজিং অ্যাপ ব্যবহারকারীদের ওপর বিশেষ নজরদারি রাখছে ফেসবুক। মার্ক জুকারবার্গের প্রতিষ্ঠানের বিরুদ্ধে বাণিজ্যিক স্বার্থে ইউজার ডাটা পাচার করার অভিযোগ রয়েছে।

কেউ ওয়াটসঅ্যাপে যোগাযোগ করলে ফেসবুক কর্তৃপক্ষ ওই ব্যবহারকারীর মোবাইল নম্বর, ডিভাইস আইডি, লোকেশন, বিনিময় তথ্যসহ ব্যবহারকারীর বিস্তারিত পরিচয় জানতে পারে। অ্যাপে ব্যবহৃত ফোন নাম্বারটি ফেসবুকের সঙ্গে অন্তর্ভুক্তির অন্যতম মাধ্যম। ২০১৬ সালেই ফেসবুক ঘোষণা করেছিল তারা ওয়াটসঅ্যাপ ইউজারদের কাছ থেকে তথ্য সংগ্রহ করছে।

ইউজাররা বলছে, যে ফিচারগুলো অ্যাপ ব্যবহারকারীদের প্রস্তাব করা হচ্ছে, সেগুলোর বিকল্প থাকা উচিত ছিল। এমন অনেক ফিচার প্রস্তাব দেয়া হতে পারে, যেগুলো কখনও ব্যবহার করা লাগবে না। কেন এমন ফিচার প্রস্তাব করা হচ্ছে, এর যাথাযথ কোনও জবাব দিতে পারেনি বিশ্বের বৃহত্তম সামাজিক যোগাযোগ মাধ্যম। ওয়াটসঅ্যাপ থেকে গ্রাহকদের তথ্য নিয়ে তা বিভিন্ন বাণিজ্যিক প্রতিষ্ঠানের কাছে বিক্রি করা হচ্ছে এ ধারণা উড়িয়ে দেয়া যায় না।

উল্লেখ্য, ফেসবুকের অন্যতম আয়ের মাধ্যম ওয়াটসঅ্যাপ। প্রায় ২১ বিলিয়ন ডলার দিয়ে  ২০১৪ সালে অ্যাপটি কিনে নিয়েছিলো তারা। এটি ব্যবহারকারীদের তিন মাস সময় বেঁধে দিয়েছে ফেসবুক কর্তৃপক্ষ। নির্ধারিত সময় পর প্রাইভেসি পলিসি মেনে না নিলে আর ব্যবহার করা যাবে না এই ইন্সট্যান্ট মেসেজিং সফটওয়্যার।